Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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