Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST2P52849 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST2P52849 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST2P52849 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST2P52849 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST2P52849 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST2P52849 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST2P52849 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms