Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPN3P20807 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms