Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms