Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GDPD1Q8N9F7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms