Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms