Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG1Q02297 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms