Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms