Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGTAO43765 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGTAO43765 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms