Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAD1L1Q9Y6D9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAD1L1Q9Y6D9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms