Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FARP1Q9Y4F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARP1Q9Y4F1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms