Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFR3BQ9Y2G0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3BQ9Y2G0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EFR3BQ9Y2G0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms