Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CTNND2Q9UQB3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms