Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRID1Q9ULK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRID1Q9ULK0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms