Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMP5Q9UJQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMP5Q9UJQ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMP5Q9UJQ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms