Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN10Q9UBB4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN10Q9UBB4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN10Q9UBB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms