Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A7Q9P2U7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A7Q9P2U7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms