Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HACD3Q9P035 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms