Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1BQ9NZR2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRP1BQ9NZR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1BQ9NZR2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms