Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms