Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms