Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJB4Q9NTQ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB4Q9NTQ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms