Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4GQ9NTN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4GQ9NTN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4GQ9NTN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA4GQ9NTN9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms