Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6BQ9NRW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms