Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4BQ9NPR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA4BQ9NPR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms