Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1BQ9H9Y6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1BQ9H9Y6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1BQ9H9Y6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms