Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRKRIP1Q9H875 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRKRIP1Q9H875 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms