Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms