Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM7Q9C029 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms