Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5DQ9BY66 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5DQ9BY66 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5DQ9BY66 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms