Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALN1Q9BXU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALN1Q9BXU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALN1Q9BXU9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms