Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF2Q9BWQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF2Q9BWQ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF2Q9BWQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF2Q9BWQ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF2Q9BWQ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms