Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMEM43Q9BTV4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM43Q9BTV4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms