Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYT3Q9BQG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT3Q9BQG1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms