Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNKPQ96T60 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms