Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEBP4Q96S96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEBP4Q96S96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEBP4Q96S96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEBP4Q96S96 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEBP4Q96S96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEBP4Q96S96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEBP4Q96S96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEBP4Q96S96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEBP4Q96S96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms