Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A9Q96Q91 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A9Q96Q91 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A9Q96Q91 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.7 ms