Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF396Q96N95 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF396Q96N95 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms