Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BORCS6Q96GS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BORCS6Q96GS4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BORCS6Q96GS4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms