Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM11Q96F44 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM11Q96F44 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms