Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS3Q969F9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS3Q969F9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms