Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL2Q8NHH9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL2Q8NHH9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms