Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM58Q8NG06 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM58Q8NG06 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM58Q8NG06 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms