Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL2Q8N4E4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL2Q8N4E4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms