Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BRAPQ7Z569 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRAPQ7Z569 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms