Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C16orf62Q7Z3J2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C16orf62Q7Z3J2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms