Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF550Q7Z398 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF550Q7Z398 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF550Q7Z398 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms