Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HS2ST1Q7LGA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms