Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00336Q6ZUF6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms