Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KIAA0408Q6ZU52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIAA0408Q6ZU52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA0408Q6ZU52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms